Google Antigravityで抗菌ペプチドの探索を加速する
Google DeepMindは、Antigravityプラットフォームが、UniProtの注釈、配列・構造の比較、文献調査を1回のセッションにまとめ、生物学者による新しい抗菌ペプチド探索を支援した事例を紹介している。Streptococcus pseudopneumoniae由来で呼吸器病原体への活性が予測されるバクテリオシン候補が見つかり、現在ウェット実験で検証中。
記事の内容
抗菌薬耐性は世界的な健康上の脅威で、2050年には年間最大1,000万人が死亡する可能性があると推計されています。抗菌ペプチド、特にバクテリオシンは従来の抗生物質に代わる有望な候補ですが、多くの候補はタンパク質データベースの未解明の領域に埋もれており、UniProtだけでも機能不明の配列が数百万あります。Google DeepMindは、Google Antigravityを「エージェント型の科学ワークベンチ」として使い、候補タンパク質の発見、構造評価、優先順位付けを1回のセッションで行う手法を紹介しています。
この手法は、配列からタンパク質の機能を予測するモデルProtNLMと、研究者とエージェントが共有する埋め込み型3Dビューアに基づきます。例として、Streptococcus pseudopneumoniaeから、Swiss-Protに有意な相同体のない97アミノ酸のバクテリオシンが選ばれ、予測構造は既知のバクテリオシンと一致し、実験計画も作成されました。この候補は他の候補とともに実験室で検証中で、ページは「生物学的にもっともらしい手がかり」であり、まだ検証されていないと述べています。
この要約は、Google DeepMind の公式ページをもとに AnnuIA が自分の言葉で作成しました。内容および権利は発行元に帰属します。元の記事をご覧ください。